Alpha Protocol является первым шпионским ролевым боевиком с видом от третьего лица, действие которого происходит в наше время. Игрок выступает в роли агента Майкла Тортона, который стал обладателем некой секретной информации, способной привести к международной катастрофе. Майкл отвергнут правительством и вынужден скрываться, чтобы в одиночку предотвратить беду. Сюжетная завязка с виду кажется простой, но не судите по первому взгляду - на самом деле, Alpha Protocol гораздо глубже, чем кажется.

Alpha Protocol – это "честная" RPG, завязанная на секретных операциях. Все умения героя зависят от количества очков, которые вы в них вложили. Таким образом, можно создавать совершенно разноплановых секретных агентов. Игра туго завязана на развитии и кастомизации персонажа. Диалоги также подчиняются принципам RPG, а мир игры всячески способствует этому, поскольку двойных агентов и прочих общительных личностей здесь представлено в избытке. При этом, от реакции игрока зависит, как к нему будут относиться различные персонажи, фракции и группировки. Нельзя, скажем, отдав документы террористов правительству полагать, что они будут вам доверять, и наоборот - не отдав бумаги, вы поднимитесь в их глазах, а правительство, возможно, о бумагах вообще не узнает.

С точки зрения боевой системы в игре нет ничего оригинального: еще один шутер со стелс-элементами от третьего лица (прицеливание осуществляется с помощью мышки), разбавленный мини-играми (взламываем терминалы и коды). Но в игре существует разветвленная система скиллов, которые даются по достижении каждого следующего уровня, включая комбо-атаку из нескольких выстрелов. Эти способности помогают скрашивать однообразие боев, и при должной комбинаторике из ваших умений может сложиться очень интересная система - причем при гибкости местной ролевой системы каждый легко может подстроить ее под себя.